NYSA được quản lý bởi một hội đồng quản trị bao gồm các giám đốc điều hành từ các công ty thành viên, bao gồm các hãng vận tải biển, nhà khai thác cảng và các công ty logistics. Chủ tịch của hiệp hội, tính đến năm 2024, là John Nardi, người dẫn dắt một đội ngũ quản lý chịu trách nhiệm về quan hệ lao động, hoạt động cảng và vận động hành lang cho ngành. Cơ cấu lãnh đạo nhấn mạnh sự hợp tác với các cơ quan công quyền, công đoàn và các đối tác kinh doanh để giải quyết các thách thức của cảng và thúc đẩy lợi ích của cộng đồng hàng hải.

NYSA không sở hữu hoặc vận hành trực tiếp các container, tàu thuyền hay thiết bị xếp dỡ hàng hóa. Thay vào đó, tổ chức này hợp tác với các thành viên của mình để triển khai các công nghệ cảng tiên tiến, hệ thống quản lý lao động và các cải tiến về năng suất. Hiệp hội hỗ trợ việc áp dụng các công cụ kỹ thuật số và cải tiến quy trình để hợp lý hóa việc tuyển dụng, đào tạo và các hoạt động cảng, góp phần hiện đại hóa cơ sở hạ tầng logistics của cảng.

Các hoạt động của NYSA tập trung tại Cảng New York và New Jersey, một trong những cửa ngõ lớn và quan trọng nhất cho thương mại quốc tế ở Bắc Mỹ. Thông qua các công ty thành viên, hiệp hội gián tiếp hỗ trợ các kết nối vận tải biển toàn cầu đến hàng trăm cảng và quốc gia trên toàn thế giới. Ảnh hưởng của NYSA mang tính khu vực, nhưng các thành viên của hiệp hội tham gia vào các tuyến thương mại toàn cầu nối liền Châu Á, Châu Âu, Nam Mỹ và các thị trường lớn khác.

Là một hiệp hội thương mại phi lợi nhuận, NYSA không công bố các số liệu doanh thu thương mại. Nguồn tài chính của hiệp hội đến từ phí thành viên và phí dịch vụ, được sử dụng để tài trợ cho các sáng kiến về quan hệ lao động, đào tạo và vận động chính sách. Sự ổn định tài chính của hiệp hội được hỗ trợ bởi cơ sở thành viên rộng lớn gồm các công ty hàng hải và logistics hàng đầu. Vị thế thị trường của NYSA được xác định bởi vai trò trung tâm của nó trong các cuộc đàm phán lao động và quản lý hoạt động cảng, chứ không phải hoạt động vận tải thương mại trực tiếp.

NYSA cung cấp một bộ dịch vụ toàn diện tập trung vào quan hệ lao động, thương lượng tập thể và quản lý lực lượng lao động cho ngành hàng hải tại Cảng New York và New Jersey. Hiệp hội điều phối các chương trình đào tạo, sáng kiến an toàn và các ủy ban năng suất nhằm nâng cao hiệu quả hoạt động cho các thành viên của mình. NYSA vận động cải thiện các quy định và chính sách, tạo điều kiện giao tiếp giữa các bên liên quan của cảng và hỗ trợ triển khai các công nghệ tiên tiến trong hoạt động cảng. Mặc dù bản thân không phải là NVOCC hay đại lý giao nhận hàng hóa, các dịch vụ của NYSA là yếu tố thiết yếu cho sự vận hành và khả năng cạnh tranh của hệ sinh thái vận tải và logistics của cảng.